Ο ΚΟΑΓ διοικείται από εννεαμελές Διοικητικό Συμβούλιο το οποίο διορίζεται κάθε τριάντα μήνες από το Υπουργικό Συμβούλιο, κατόπιν σύστασης του Γνωμοδοτικού Συμβουλίου. Το σημερινό Διοικητικό Συμβούλιο, το οποίο άρχισε τη θητεία του τον Φεβρουάριο του 2024 απαρτίζεται από τους εξής:
Μετά από έγκριση του Υπουργικού Συμβουλίου, το Διοικητικό Συμβούλιο του ΚΟΑΓ διορίζει με ιδιωτική σύμβαση πενταετούς διάρκειας τον Γενικό Διευθυντή του.O Γενικός Διευθυντής είναι ο πρώτος εκτελεστικός λειτουργός του ΚΟΑΓ και φέρει την ευθύνη της υλοποιήσεως της πολιτικής του και της διεκπεραίωσης της καθημερινής εργασίας.
Από την 1 Ιουλίου 2021, Γενική Διευθύντρια του ΚΟΑΓ είναι η Ελένη Συμεωνίδου.
Το προσωπικό του ΚΟΑΓ απαριθμεί σήμερα 30 άτομα, τα οποία στελεχώνουν, ανάλογα με την κατάρτισή τους, την Τεχνική Υπηρεσία και τις Λογιστικές και Γραμματειακές Υπηρεσίες.
